【佳学基因检测】基因检测如何改善三阴性乳腺癌的治疗方案
乳腺癌不同亚型的基因检测导读：
《乳腺癌不同亚型的基因检测对治疗的帮助作用》总结了现有的治疗方案、治疗药物及其在治疗三阴性乳腺癌患者中的疗效，并讨论了一些新的临床前研究和靶向治疗方案，旨在为三阴性乳腺癌治疗方案和靶点提供新的思路和方向。
基因检测明确三阴型乳腺癌后的治疗方案：
《乳腺癌基于基因检测结果的个性化治疗》通过对对587例三阴性乳腺癌患者的肿瘤样本进行了基因表达谱分析，并将三阴性乳腺癌分为六个亚型：基底样1型（BL1）、基底样2型（BL2）、间充质型（M）、间充质干细胞样（MSL）、免疫调节（IM）和管腔雄激素受体（LAR）。致病基因鉴定基因解码研究人员还进行了基因分析，比较了现有的三阴性乳腺癌乳腺癌细胞系，将三阴性乳腺癌细胞分为六种不同的亚型，从而为三阴性乳腺癌的临床治疗提供了一个准确的细胞模型。
三阴型乳腺癌的基因检测分型及其个性化治疗方案
| TNBC亚型 | 遗传异常 | 细胞系 | 亚型相关性（p值） | 组织学 | 基因检测结果 |
| 基底样1型 | 细胞周期基因表达 | HCC2157 | 0.66 (0.00) | DC | BRCA1; STAT4; UTX |
| DNA修复基因（ATR-BRCA途径） | HCC1599 | 0.62 (0.00) | DC | BRCA2; TP53; CTNND1; TOP2B; CAMK1G | |
| 增殖基因 | HCC1937 | 0.28 (0.00) | DC | BRCA1; TP53; MAPK13; MDC1 | |
| HCC1143 | 0.26 (0.00) | IDC | TP53 | ||
| HCC3153 | 0.24 (0.00) | DC | BRCA1 | ||
| MDA-MB-468 | 0.19 (0.06) | DC | PTEN; RB1; SMAD4; TP53 | ||
| HCC38 | 0.19 (0.01) | CDKN2A; TP53 | |||
| 基底样2型 | 生长因子信号通路（EGFR、MET、NGF、Wnt/β-连环蛋白、IGF-1R） | SUM149PT | 0.30 (0.00) | INF | BRCA1 |
| 糖酵解，糖异生 | CAL-851 | 0.25 (0.00) | IGA | RB1; TP53 | |
| 肌上皮标志物的表达 | HCC70 | 0.24 (0.04) | DC | PTEN; TP53 | |
| HCC1806 | 0.22 (0.00) | ASCC | CDKN2A; TP53; UTX | ||
| HDQ-P1 | 0.18 (0.17) | IDC | TP53 | ||
| 免疫调节型 | 髓质BC（预后良好的罕见TNBC）的免疫细胞过程（CTLA4、IL2、IL7途径、抗原处理/呈递）基因特征 | HCC1187 | 0.22 (0.00) | DC | TP53; CTNNA1; DDX18; HUWE1; NFKBIA |
| DU4475 | 0.17 (0.00) | DC | APC; BRAF; MAP 2 K4; RB1 | ||
| 间充质型 | 细胞运动 | BT-549 | 0.21 (0.00) | IDC | PTEN; RB1; TP53 |
| 细胞分化 | CAL-51 | 0.17 (0.00) | AC | PIK3CA | |
| 生长因子信号传导 | CAL-120 | 0.09 (0.00) | AC | TP53 | |
| 急诊室 | |||||
| 间充质干细胞型 | 类似于M+ | HS578T | 0.29 (0.00) | CS | CDKN2A; HRAS; TP53 |
| 低增殖 | MDA-MB-157 | 0.25 (0.00) | MBC | NF1; TP53 | |
| 血管生成基因 | SUM159PT | 0.14 (0.00) | ANC | PIK3CA; TP53 HRAS | |
| MDA-MB-436 | 0.13 (0.00) | IDC | BRCA1; TP53 | ||
| MDA-MB-231 | 0.12 (0.00) | IDC | BRAF; CDKN2A; KRAS; NF2; TP53; PDGFRA | ||
| 管腔雄激素受体 | 雄激素受体基因 | MDA-MB-453 | 0.53 (0.00) | AC | PIK3CA; CDH1; PTEN |
| 管腔基因表达模式 | SUM185PE | 0.39 (0.00) | DC | PIK3CA | |
| 分子顶分泌亚型 | HCC2185 | 0.34 (0.00) | AC | PIK3CA | |
| CAL-148 | 0.32(0.00) | AC | PIK3CA; RB1; TP53; PTEN | ||
| MFM-223 | 0.31 (0.00) | PIK3CA; TP53 | |||
《肿瘤850基因检测》的大数据统计结果显示三阴性乳腺癌肿瘤样本的基因表达谱分析发现基底样1型，即BL1亚型中细胞周期调节和DNA修复相关基因的异常表达，这些基因包括MYC、PIK3CA、CDK6、AKT2、KRAS、FGFR1、IGF1R、CCNE1和CDKN2A/B的高扩增，以及BRCA2、PTEN、MDM2、RB1和TP53等DNA修复相关基因的高杂合或纯合缺失）。三阴性乳腺癌中的基底样1型可能的治疗药物包括聚ADP核糖聚合酶（PARP）抑制剂和基因毒性药物。三阴性乳腺癌中的基底样1型。三阴性乳腺癌中的基底样2型（BL2亚型）具有信号通路的异常激活，如EGFR、MET、NGF、Wnt/β-连环蛋白和IGF-1R通路，潜在的靶向治疗药物包括mTOR抑制剂和生长因子抑制剂（拉帕替尼、吉非替尼和西妥昔单抗）。
三阴性乳腺癌中的间充质型（M亚型）具有高度激活的细胞迁移相关信号通路（由肌动蛋白调节）、细胞外基质-受体相互作用通路和分化通路（Wnt通路、间变性淋巴瘤激酶通路、转化生长因子（TGF）-β信号），因此也被称为化生性乳腺癌。三阴性乳腺癌中的间充质型（M亚型）具有肉瘤样或鳞状上皮细胞样组织特征，易对化疗药物产生耐药性。因此，三阴性乳腺癌中的间充质型患者者可以使用mTOR抑制剂或靶向上皮-间质转化的药物治疗。
与M亚型相比，三阴性乳腺癌中的间充质干细胞亚型表达低水平的细胞增殖相关基因和高水平的干细胞相关基因，这些基因包括ABCA8、PRORC、ENG、ALDHA1、PER1、ABCB1、TERT2IP、BCL2、BMP2和THY、HOX基因（HOXA5、HOXA10、MES1、MES2、MEOX1、MEOX2和MSX1）和间充质干细胞特异性标记物（BMP2、ENG、ITGAV、KDR、NGFR、NT5E、PDGFR、THY1和VCAM1）。三阴性乳腺癌中的间充质干细胞亚型的基因解码暗示患者可能接受PI3K抑制剂、Src拮抗剂或抗血管生成药物治疗。基因解码研究还表表明，一种Abl/Src抑制剂达沙替尼可用于治疗M型和MSL型乳腺癌患者。
IM亚型显著丰富了免疫细胞相关基因和信号转导途径，如Th1/Th2途径、NK细胞途径、B细胞受体信号途径、树突状细胞（DC）途径、T细胞受体信号途径、白细胞介素（IL）-12途径和IL-7途径。具有基因解码能力的临床大夫考虑，IM亚型与乳腺髓样癌高度相似。建议使用PD1、PDL1、CTLA-4和其他免疫检查点抑制剂治疗IM亚型乳腺癌患者。
LAR亚型的基因表达谱与其他TNBC亚型显著不同。尽管LAR亚型不表达ER受体，但它确实具有高度激活的激素相关信号通路（包括类固醇合成、卟啉代谢和雄激素/雌激素代谢）。值得注意的是，雄激素受体（AR）在LAR亚型乳腺癌中高度表达，其mRNA水平是其他TNBC亚型的9倍。免疫组织化学还检测AR的高表达，以及大量AR下游代谢标记物及其辅助激活剂（DHCR24、ALCAM、FASN、FKBP5、APOD、PIP、SPDEF和CLDN8）在LAR亚型中的表达。以肿瘤的发生与恶变机理做为分析基础的基因解码建议LAR亚型乳腺癌患者进行抗AR治疗。
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