【佳学基因检测】综合 miRNA 序列分析揭示弥漫性大 B 细胞淋巴瘤患者的生存差异

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数据分析肿瘤基因检测位点的全面性与准确性《肿瘤个性治疗的方法与措施》《Nature》在2020 Oct; 586(7831): 763–768.发表了一篇题目为《综合 miRNA 序列分析揭示弥漫性大 B 细胞淋巴瘤患者的生存差异》肿瘤靶向药物治疗基因检测临床研究文章。该研究由Alexander G. Bick,‡ Joshua S. Weinstock, Satish K. Nandakumar, Charles P. Fulco, Erik L. Bao, Seyedeh M. Zekavat, Mindy D. Szeto, Xiaotian Liao, Matthew J. Leventhal, Joseph Nasser, Kyle Chang, Cecelia Laurie, Bala Bharathi Burugula, Christopher J. Gibson, Amy E. Lin, Margaret A. Taub, Francois Aguet, Kristin Ardlie, Braxton D. Mitchell, Kathleen C. Barnes, Arden Moscati, Myriam Fornage, Susan Redline, Bruce M. Psaty, Edwin K. Silverman, Scott T. Weiss, Nicholette D. Palmer, Ramachandran S. Vasan, Esteban G. Burchard, Sharon L. R. Kardia, Jiang He, Robert C. Kaplan, Nicholas L. Smith, Donna K. Arnett, David A. Schwartz, Adolfo Correa, Mariza de Andrade, Xiuqing Guo, Barbara A. Konkle, Brian Custer, Juan M. Peralta, Hongsheng Gui, Deborah A. Meyers, Stephen T. McGarvey, Ida Yii-Der. Chen, M. Benjamin Shoemaker, Patricia A. Peyser, Jai G. Broome, Stephanie M. Gogarten, Fei Fei Wang, Quenna Wong, May E. Montasser, Michelle Daya, Eimear E. Kenny, Kari E. North, Lenore J. Launer, Brian E. Cade, Joshua C. Bis, Michael H. Cho, Jessica Lasky-Su, Donald W. Bowden, L. Adrienne. Cupples, Angel C. Mak, Lewis C. Becker, Jennifer A. Smith, Tanika N. Kelly, Stella Aslibekyan, Susan R. Heckbert, Hemant K. Tiwari, Ivana V. Yang, John A. Heit, Steven Lubitz, Jill M. Johnsen, Joanne E. Curran, Sally E. Wenzel, Daniel E. Weeks, Dabeeru C. Rao, Dawood Darbar, Jee-Young Moon, Russell P. Tracy, Erin J. Buth, Nicholas Rafaels, Ruth J.F. Loos, Peter Durda, Yongmei Liu, Lifang Hou, Jiwon Lee, Priyadarshini Kachroo, Barry I. Freedman, Daniel Levy, Lawrence F. Bielak, James E. Hixson, James S. Floyd, Eric A. Whitsel, Patrick T. Ellinor, Marguerite R. Irvin, Tasha E. Fingerlin, Laura M. Raffield, Sebastian M. Armasu, Marsha M. Wheeler, Ester C. Sabino, John Blangero, L. Keoki Williams, Bruce D. Levy, Wayne Huey-Herng Sheu, Dan M. Roden, Eric Boerwinkle, JoAnn E. Manson, Rasika A. Mathias, Pinkal Desai, Kent D. Taylor, Andrew D. Johnson, NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine Consortium, Paul L. Auer, Charles Kooperberg, Cathy C. Laurie, Thomas W. Blackwell, Albert V. Smith, Hongyu Zhao, Ethan Lange, Leslie Lange, Stephen S. Rich, Jerome I. Rotter, James G. Wilson, Paul Scheet, Jacob O. Kitzman, Eric S. Lander, Jesse M. Engreitz, Benjamin L. Ebert, Alexander P. Reiner, Siddhartha Jaiswal, Gonçalo Abecasis, Vijay G. Sankaran, Sekar Kathiresan, and Pradeep Natarajan,等完成。促进了肿瘤的精准治疗与个性化用药的发展，进一步强调了基因信息检测与分析的重要性。

肿瘤靶向药物及精准治疗临床研究内容关键词：

弥漫性大 B 细胞淋巴瘤,DLBCL,microRNAs,miRNAs,石蜡包埋组织,国际预后指数评分,淋巴瘤形成。

肿瘤靶向治疗基因检测临床应用结果

背景：弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 是一种侵袭性疾病，30% 至 40% 的患者无法通过可用的主要治疗治愈。 microRNA (miRNA) 是减弱其 mRNA 靶标表达的 RNA 分子。为了表征 DLBCL miRNome，我们对来自 92 个 DLBCL 和 15 个良性中心母细胞新鲜冷冻样品以及来自 140 个 DLBCL 福尔马林固定、石蜡包埋的组织样品的 miRNA 进行了测序以进行验证。结果：我们鉴定了已知和候选的新 miRNA，其中 25 个相关生存独立于细胞来源和国际预后指数评分，这是既定的结果指标。在这 25 种 miRNA 中，有 6 种 miRNA 在我们的验证队列中与存活率显着相关。 miR-28-5p、miR-214-5p、miR-339-3p 和 miR-5586-5p 的大量表达与优越的结果相关，而 miR-324-5p 和 NOVELM00203M 的大量表达与较差的结果相关。将 DLBCL miRNA-seq 表达谱与其他癌症类型的表达谱进行比较，确定了在 B 细胞环境中更丰富的 miRNA。 miRNA 的无监督聚类确定了两组患者的结果有明显差异。我们的综合 miRNA 和 mRNA 表达分析表明，DLBCL 中丰富的 miRNA 似乎可以调节参与代谢、细胞周期和蛋白质修饰的基因的表达。此外，这些 miRNA，包括一种候选新 miRNA，miR-10393-3p，似乎靶向染色质修饰基因，这些基因是非霍奇金淋巴瘤中体细胞突变的常见靶标。结论我们对 DLBCL mirNome 的全面序列分析确定了候选新 miRNA 和 miRNA与生存相关，加强了先前突变分析的结果，并揭示了对淋巴瘤发生具有重要意义的调控网络。

肿瘤发生与复发转移国际数据库描述：

Diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL,microRNAs, miRNAs,paraffin-embedded tissue,International Prognostic Index scores,lymphomagenesis.

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