【佳学基因检测】基因解码基因检测揭示正常细胞抑制肿瘤的原因

肿瘤的基因检测的位点从正常细胞的研究中获得数据：

《肿瘤发生的分子物学基础》清楚地阐述了MicroRNA（miRNA）在各种类型的癌症中的表达调控异常。将其纳入肿瘤基因精准用药850中，在幅度提高肿瘤致病基因及靶向药物发现的准确性。而且基于对MicroRNA的作用的基因解码结果，另一种特殊的靶向药物：反义寡核苷酸药物被巧妙地设计出来，并被用于阻断导致肿瘤发生的肿瘤miR。但作为一种有效的抗癌策略，肿瘤抑制性miRNA的递送具有巨大的潜力。《正常组织中的miRNA生理功能的基因解码》的目的在于对于在各种类型的肿瘤中低表达但在多种正常组织中大量表达的miRNA的鉴定及功能分析。
 

如何分析正常组织和异常肿瘤组织中的miRNA的作用

从TCGA大数据中心选择获取14种癌症类型的miRNA高通量、下一代测序（NGS)数据。使用limma软件包（R编程）计算肿瘤和正常样本之间miRNA表达的显著差异。调整后的p值<0.05用于比较正常和肿瘤miRNA表达谱。使用TargetScan、miRanda和miRDB获得预测的基因靶点，然后使用Enrichr进行基因本体分析。只有调整后p<0.05的GO术语被认为具有统计学意义。数据分析后所得的数据再通过细胞活力测定和流式细胞术等真实实验室数据的所有数据均以平均值±SEM表示，并使用GraphPad Prism软件分析其差异（Student’s t检验，p<0.05）。

从miRNA基因解码中如何增加了可信赖的基因检测位点

通过汇编来自癌症基因组图谱（TCGA）泛癌症项目的所有公开可用的miRNA图谱数据，《肿瘤发生的分子物学基础》发现了一小组肿瘤抑制miRNA（基因解码称之为“正常组分”），它们在14种正常组织中高度表达，但在相应的肿瘤组织中低表达。有趣的是，肌肉组织中富有的miRNA（例如miR-133a/b和miR-206）和来自DLK1-DIO3位点的miRNA（例如miR-381和miR-411）构成了正常组分的很大一部分。此外，《正常组织中的miRNA生理功能的基因解码》明确了定义了CCCGU基序特异性基因序列在肿瘤miR的种子序列中缺失，但在一部分肿瘤抑制性miRNA中存在。最后，候选正常组分在几种癌细胞类型中的功能获得表明，miR-206和miR-381在体外对多种癌细胞类型发挥最有效的抑制作用。这些基因位点的突变成为佳学基因解码高度推荐的肿瘤致病基因位点。它们到目前为止尝未进入大多数肿瘤致病基因鉴定基因检测及肿瘤用药指导基因检测中。

《正常组织中的miRNA生理功能的基因解码》研究结论：

发现了这是一组抑制肿瘤的miRNA，强调了它们具有针对多种肿瘤的miRNA替代疗法的潜力。这些基因序列可以用来进行肿瘤基因检测，从而增加肿瘤发病原因的基因检测及肿瘤精准用药基因检测的准确性。

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