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【佳学基因检测】高通量测序(NGS)基因检测中扩增子的选择、设计及优化

在许多高通量DNA测序(HTS)应用中,扩增子测序一直是首选方法。迄今为止,人们一直非常关注HTS提供的数据量迅速增长的分析方法。相比之下,对于样品制备的重要性和库生成的保真度的考虑

佳学基因检测】高通量测序(NGS基因检测中扩增子的选择、设计及优化


在新一代基因测序(NGS),如何获取更多的基因信息是基因解码的第一步。获取信息多、全、准确,才能做好基因解码。根据佳学基因高通量测序技术研发中心介绍。在目前的高通量DNA测序(HTS)应用中,扩增子测序一直是首选方法。但是很多基因测序机构只是非常关注HTS提供的数据量迅速增长的分析方法及常说的生物信息分析方法。对于样品制备的重要性和生成的测序文库是否真实的反映了样本基因序列的真实性缺乏关注。再多的、再复杂的、再炫酷的高端生物信息学也无法弥补制备不良的样本,因此,在制定基因解码过程中的基因测序标准流程中,佳学基因提出必须认真关注工作流程中的样本制备和文库生成,尤其是涉及多个PCR步骤的样本制备和文库生成。佳学基因付出大量精力,研究和探讨扩增子工作流程中的实验操作方面的常常出现的问题,以协调样品采集、测序文库制备工作中的各个环节。通过提供佳学基因总结收集的经验数据来说明问题存在范围。最后,从基因测序数据生成的实际情况,分析影响测序结果的各种参数。佳学基因介绍高通量测序的技术细节及分析流程的重要性,以实现有意义的、经得起各种验证的、可适当分析的数据。由于佳学基因将扩增子测序应用到从法医到环境DNA(eDNA),从致病基因的鉴定到靶向药物的寻找,从肿瘤风险的预测到肿肿瘤微小残留灶的检测中,具备不断发展的应用和技术趋动力。因此,建立有效的工作流程极为重要。

不可否认,与高通量DNA测序(HTS)相关的无数名称和首字母缩略词给人留下了深刻的印象,而该技术本身被证明有用的应用数量也与此相匹配。迄今为止,扩增子测序是许多HTS研究中的首选方法,通过该方法可以生成PCR产物,转化为文库,合并然后测序。扩增子测序已被广泛用于或拟用于多种环境,包括生物监测、饮食分析和细菌宏基因组学。由于这项技术可以很容易地应用于一系列学科,它有时会成为寻求利用它的科学家的雷区。对于那些在湿实验室分子生物学技能或计算生物信息学方面经验有限的人来说尤其如此。这些领域中的后一个受到了广泛关注;前者的重要性常常被低估。

 

(责任编辑:佳学基因)
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