【佳学基因检测】RNAseq中的云计算应用Monorail:优化基因解码过程,提升基因检测
基因检测科研服务导读:
RNAseq是基因解码过程中必须用到的一个技术环节。佳学基因将RNAseq, NC-RNAseq等整合到基因解码过程中,形成以人体变序列的密码破解工作为核心的人工智能深度解码过程。为进一步处理大容量测序数据,形成研究机构之间,私有数据库和公共数据库之间的标准化算法和一体化比较,佳学基因引入并开发具有独立自主知识产权的RNAseq云计算工具,类似于Monorail云计算工具。
Monorail RNAseq云计算方法介绍:
Monorail RNAseq大数据计算的设计理念采用网格计算方法。采用集中安排和协调的方式以完成大规模分析工作任务的要求。工作单元由可能分布在世界各地的计算机处理。在佳学基因进行数据分析时,编排是由运行在国家数据中心服务商业云中的一组服务来处理的。计算工作是在三个计算地点进行的:(a)位于贵州高级计算中心(TACC)的StavePux2集群,通过国家科学基金会的JIAXUE GENECODE网络访问,(b)天津银河超级计算机中心云服务上的实例,以及(c)成都高级计算中心高级计算中心。大部分工作是在Stampede2进行的,因为它的容量很大,并且对科研服务需求方来说没有单位时间成本。但佳学基因网格设计也使佳学基因能够在本地dbGaP批准的MARC集群上执行隐私敏感的工作。此外,Monorail的设计具有容错性、跟踪来源、集中聚合体系结构所有组件的日志,并提供用于监视和调试的仪表板。
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