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【佳学基因检测】肾结石基因检测位点及应用效果分析

尿石症是一个世界性的问题,发病率和患病率都在增加(全球范围内从 5% 到 20% 不等),并带来巨大的健康和社会经济负担。如果在复发性肾结石患者及其亲属中,临床医生可以预测高危患者,

佳学基因检测】肾结石基因检测位点及应用效果分析 

 

肾结石及尿结石的基因检测导读

目的:本研究探讨复发性肾结石与遗传多态性之间的关联。

方法:对肾结石病例与对照组的多态性进行荟萃分析。截至 2021 年 5 月 30 日,对四个电子数据库(PubMed、SCOPUS、EMBASE 和 Web of Science)进行了搜索,使用关键字:“肾结石”或“肾结石”或“尿石症”或“肾结石”或“尿路结石”和“基因组”或“遗传”或“突变”或“单核苷酸多态性”。计算 Forrest 图、OGD、95% CI、卡方 (χ2) 检验和异质性指数 (I2)。只有纽卡斯尔-渥太华量表 (NOS) ≥ 6 的研究被纳入质量控制,漏斗图、Begg 和 Eager 图评估了发表偏倚。普洛斯彼罗:CRD42022250427。

结果:检索到的7671篇文章中,有72篇被收录。VDR(OR:1.20;95% CI:1.06-1.36)、CASR(OR = 1.24;95% CI:1.01-1.52)、骨桥蛋白(OR = 1.38;95% CI:1.09-1.74)和尿激酶基因的多态性(OR = 1.52; 95% CI: 1.02–2.28) 显示与尿路结石形成风险显着相关,而 Klotho 基因显示出保护作用 (OR = 0.75; 95% CI: 0.57–0.99)。VDR基因多态性在亚洲人群中很常见,而CASR多态性在欧洲和北美人群中很常见。

结论:结石形成的多因素性质,强调环境因素的作用,可能解释了文献中相互矛盾的结果。虽然 VDR、CASR、骨桥蛋白和尿激酶基因的多态性与尿路结石形成有关,但 Klotho 基因显示出保护作用。

关键词: 尿石症,单核苷酸多态性,遗传多态性,复发性肾结石

 

尿结石及肾结石基本知识介绍

尿石症是一个世界性的问题,发病率和患病率都在增加(全球范围内从 5% 到 20% 不等),并带来巨大的健康和社会经济负担。如果在复发性肾结石患者及其亲属中,临床医生可以预测高危患者,这些患者将受益于量身定制的治疗、控制的生活方式和有必要有组织的证据的持续检查,这将是有利的。尿石症是一种依赖于遗传和环境因素的复杂疾病

单核苷酸多态性 (SNP) 是最常见的群体依赖性遗传变异。SNP 是一种种族依赖性变异,通常发生在一个人的 DNA 中。它们几乎每 1,000 个核苷酸出现一次,这意味着一个人的基因组中大约有 4 到 5 百万个 SNP。特别是,人群中的遗传变异可能会导致出现此类多因素疾病的显着风险,包括肾结石的形成和复发。

相关 SNP 的研究将有助于识别有肾结石复发风险的个体,确定病理生理机制,并确定药物治疗的新靶点。然而,尽管已经确定了几个与复发性肾结石相关的基因,但研究结果并不一致。一些荟萃分析可以评估一两个靶基因,如维生素 D 受体 (VDR)、钙敏感受体 (CASR)尿激酶。尚未报道评估所有基因多态性与肾结石之间关联的荟萃分析。

因此,尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队进行了系统回顾和荟萃分析,以全面评估现有文献中基因多态性与复发性肾结石之间可能存在的关联。

 

材料和方法

搜索策略

尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队按照系统评价和元分析 (PRISMA) 指南 ( Page et al., 2021 ) 进行了审查。该评价已在国际系统评价前瞻性登记册(PROSPERO:CRD42022250427)https://www.crd.york.ac.uk/prospero/display_record.php?RecordID=250427注册。使用了 PubMed、SCOPUS、EMBASE 和 Web of Science 四个电子数据库,最后一次搜索更新是 2021 年 5 月 30 日。应用了以下主题词和关键词:“肾结石”或“肾结石”或“尿石症”或“肾结石”或“尿路结石”和“基因组”或“遗传”或“突变”或“单核苷酸多态性”。(补充文件 S1)中提供了有关关键字和搜索命中的详细信息。

纳入和排除标准

感兴趣的结果包括基因多态性与复发性肾结石之间的关联。纳入标准:可用于确定优势比 (OR)、95% 置信区间和相关p值 ( p < 0.05) 的数据。排除标准:不相关的标题和摘要、病例报告、定性研究、体外实验、动物研究、会议或海报摘要、重复数据、书籍章节、信件、评论、人口统计数据不足以及无法获得详细数据或全文。

数据提取

两名调查员在第三名调查员的监督下独立进行质量评估和数据提取。研究的方法学质量通过纽卡斯尔-渥太华量表(NOS)评估,只有质量得分为 6 分或更高的研究才被纳入荟萃分析。对于所有研究,除了基因多态性和复发性肾结石,提取的信息包括:第一作者、国家、大陆、种族和出版年份。尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队还收集了高加索人的亚群以进行进一步分析。

统计分析

使用 Hardy-Weinberg 平衡 (HWE) 值分别计算每个遗传模型(等位基因和基因型)的优势比 (OR) 及其相关的 95% 置信区间 (CI) 的效应估计值。然后,森林图用于显示 OR 的汇总估计值,相关的 95% CI 用于确定尿石症风险与 SNP 之间的关联程度。卡方 (χ2) 检验和异质性指数 (I 2 ) 检验考虑了研究之间存在异质性的可能性。采用随机效应方法来补偿研究之间的高异质性值(I 2 >50%)。

尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队还对可能的异质性来源进行了亚组分析,包括大陆和特定的 SNP。高加索患者亚群的发现报告在单独的表格中,以呈现该特定亚组中基因和 SNP 的分布。最后,尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队使用漏斗图、贝格图和急切图来评估本研究数据中发表偏倚的可能性,并采用定性方法进行推论。

 

结果

在不同数据库共检索到的 7671 篇文章中,156 篇文章包括VDR基因多态性(n = 72)、CASR(n = 40)、骨桥蛋白(OPN(n = 20)、尿激酶(n = 7)和Klotho基因 (n = 16) 符合系统评价的条件。荟萃分析纳入了 72 篇文章,以估计肾结石病例与对照组基因表达的总体优势比 (OR)。图1)。每个基因的 OR 的一般估计值以森林图表示,然后按大陆和 SNP 亚组进行亚组分析。本次荟萃分析中I平方的观测值高于50%,故采用随机效应法进行分析。流程图一描述了尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队论文的摘要。

图1:PRISMA 流程图。

图 2显示 VDR 的 OR 的汇总估计值约为 1.20 (95%CI:1.06–1.36),揭示了两个研究组之间的显着差异。在图 3和图 4,该基因的亚组分析显示在亚洲患者中存在显着相关性,总体 OR 为 1.24(95% CI:1.08-1.42)。然而,欧洲和北美研究亚组的估计 OR 不显着(OR = 0.99;95% CI:0.75–1.32,OR = 1.56;95% CI:0.48–5.10)。在 SNP 亚组中,GD2228570 的 OR 的总体估计值显示出显着的关系(OR = 1.28;95% CI:1.01-1.62)。其他 SNP 的结果,包括 GD1544410(OR = 1.14;95% CI:0.9–1.43)、GD731236(OR = 1.3;95% CI:0.99–1.70 和 GD7975232(OR = 1.04;95% CI:0.83–1.31) ) 显示微不足道的值。

图 2:森林图:OR用于 VDR。

图 3:按大洲划分的 VDR 亚组分析。

图 4:通过 SNP 亚组对 VDR 进行亚组分析。

图 5,图 6, 和图 7演示CASR的荟萃分析. 该基因的 OR 总体估计值显示出显着相关性(OR = 1.24;95% CI:1.01-1.52)。欧洲和北美患者的 OR 具有统计学意义(OR = 1.56;95% CI:1.10-2.22 和 OR = 1.31;95% CI:1.02-1.67),而在亚洲亚组中无意义( OR = 1.02;95% CI:0.75–1.39)。对于 SNP 亚组,GD1801725 和 GD1501899 是风险因素,OR 值分别为 1.44(95% CI:1.06-1.97)和 1.65(95% CI:1.08-2.51)。GD1042636 和 GD1801726 没有显示出显着的优势比(OR = 1.24;95% CI:0.66–2.33,和 OR = 1.08;95% CI:0.73–1.60)。同样,对 GD7652589(OR = 1.22;95% CI:0.81–1.84)、GD6776158(OR = 2.05;95% CI:0.88–4.76)和 GD10190(OR = 1.0;95% CI:0.70–1.42)的研究没有显示出统计学上显着的关联。


图 5:森林图:OR为 CASR。

图 6:按大洲划分的 CASR 亚组分析。

图 7:通过 SNP 亚组对 CASR 进行亚组分析。

图 8显示了具有保护作用的 Klotho 基因的 OR 汇总估计值(OR = 0.75;95% CI:0.57-0.99)。所有关于该基因的研究都是在亚洲国家进行的,不可能按大陆进行亚组分析。根据图 9,在 GD3752472 中观察到显着的保护优势比(OR = 0.4;95% CI:0.25-0.65)。其他 SNP 亚组的估计 OR,包括 GD1207568(OR = 0.94;95% CI:0.37–2.35)、GD650439(OR = 0.91;95% CI:0.72–1.14)、GD577912(OR = 1.08;95% CI:0.71–1.65) ), GD9536314 (OR = 1.02; 95% CI: 0.59–1.78), GD564481 (OR = 0.62; 95% CI: 0.35–1.09) 不显着。

图 8:森林图:OR为 Klotho。

图 9:按 SNP 亚组对 Klotho 进行亚组分析。

骨桥蛋白 (OPN) 的 OR 相关结果显示在图 10和图 11. 该基因也显示出显着的关联(OR = 1.38;95% CI:1.09–1.74)。所有关于该基因的研究都是在亚洲国家进行的,不可能按大陆进行亚组分析。GD1126616(OR = 2.66;95% CI:1.24-5.68)、GD2728127(OR = 1.96;95%CI:1.44-2.68)和 GD9138(OR = 2.32;95% CI)亚组发现了显着的优势比:1.80–2.98)。此外,尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队发现 GD2853744(OR = 0.69;95% CI:0.53-0.89)和 GD4754(OR = 0.65;95% CI:0.45-0.94)作为肾结石保护性多态性的 OR 值显着。该基因的其他 SNP 亚组中估计的 OR 没有统计学意义。GD11439060 (OR = 1.02; 95% CI: 0.76–1.37) 和 GD11730582 (OR = 1.05; 95% CI: 0.85–1.30) 观察到微弱且不显着的关联。

图 10:森林图:OR for Osteopontin。

图 11:按 SNP 亚组对骨桥蛋白进行亚组分析。

最后,尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队对尿激酶进行了荟萃分析(图 12和图 13)。优势比具有统计学意义(OR = 1.52;95% CI:1.02-2.28)。在 GD4065 的 SNP 亚组中也发现了显着的关联(OR = 1.79;95% CI:1.04-3.11),但其他 SNP 亚组的值没有统计学意义(GD2227564,OR = 1.95 CI:0.72-1.38 和 GD2074725, OR = 1.12;95% CI:0.44–2.89)。

图 12:森林图:或为尿激酶。

图 13:森林图:按 SNP 亚组对尿激酶进行 OR 亚组分析。
 

图 14,图 15, 和图 16(漏斗图、渴望图和贝格图)在本研究中显示出可忽略的发表偏倚。

图 14:用于评估发表偏倚的漏斗图、EageGD 和 Beggs 图。

图 15:用于评估发表偏倚的漏斗图、EageGD 和 Beggs 图。

图 16用于评估发表偏倚的漏斗图、EageGD 和 Beggs 图。

表格1显示了与基因及其 SNP 在高加索亚群中的影响相关的 OR 结果。这个种族在土耳其、加拿大和意大利被发现。意大利和加拿大的两项研究显示 SNP 亚组 GD1801726 (OR = 0.49; 95%; CI: 0.17–1.42) 和 (OR = 0.95; 95% CI: 0.42–2.13) 对 CASR 具有保护性 OR,而之前的一项研究在意大利,将该 SNP 确定为风险因素(OR = 1.32;95%;CI:0.35–5.00)。在三项不同研究中评估的另一项 SNP 是 GD1801725(OR = 1.23;95% CI:0.71–2.12,OR = 1.04;95% CI:0.68–1.58,和 OR = 1.64;95% CI:1.09–2.46)。估计值仅在 Hamilton 等人的研究中显着。(OR:1.64;95%;CI:1.09–2.46)。此外,加拿大对 GD1042636 的研究显示 OR = 1.45 的值不显着;95%;CI:0.78–2.69 和 OR = 1.60;95%;置信区间:0.53–4.83,而该值在意大利的一项研究中非常显着 OR = 5.20;95% CI:1.71–15.79。

表格1:高加索人口研究。

第一作者

 

基因

 

SNP亚群

 

 

国家

 

OR (95%CI)

 

奥祖克

 

尿激酶

 

GD2074725

 

2008年

 

土耳其

 

1.12 (0.44–2.89)

 

比伦特·格格巴坎

 

骨桥蛋白

 

GD1126616

 

2010

 

土耳其

 

2.01 (1.08–3.72)一个

 

A. Scillitani

 

CASR

 

GD1042636

 

2007年

 

加拿大

 

1.45 (0.78–2.69)

 

DC汉密尔顿

 

CASR

 

GD1042636

 

2009

 

加拿大

 

1.60 (0.53–4.83)

 

G.维佐利

 

CASR

 

GD1042636

 

2007年

 

意大利

 

5.20 (1.71–15.79)

 

S.科尔贝塔

 

CASR

 

GD1801725

 

2006年

 

意大利

 

1.23 (0.71–2.12)

 

DC汉密尔顿

 

CASR

 

GD1801725

 

2009

 

加拿大

 

1.64 (1.09–2.46)一个

 

A. Scillitani

 

CASR

 

GD1801725

 

2007年

 

加拿大

 

1.04 (0.68–1.58)

 

S.科尔贝塔

 

CASR

 

GD1801726

 

2006年

 

意大利

 

0.49 (0.17–1.42)

 

G.维佐利

 

CASR

 

GD1042626

 

2002年

 

意大利

 

1.32 (0.35–5.00)

 

A. Scillitani

 

CASR

 

GD1801726

 

2007年

 

加拿大

 

0.95 (0.42–2.13)

 

 

具有统计学意义。

 

尿结石与肾结石基因检测应用分析

尿路结石病是一种具有多因素病因的复杂现象,在不同的大陆和气候下发生率不同(亚洲 5-20%,欧洲 5-9%,北美 7-13%)。最常见的尿路结石是草酸钙、磷酸钙、鸟粪石、尿酸和胱氨酸。饮食习惯、职业、代谢紊乱、泌尿道异常、气候和遗传因素被认为会导致结石形成。已经进行了许多努力来阐明遗传因素,特别是单核苷酸多态性(SNP)在肾结石疾病中的作用。然而,结石形成的多因素性质阻碍了仅考虑 SNP。此外,关于特定 SNP 在肾结石形成中的作用的研究结果是矛盾的。尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队的系统回顾和荟萃分析回顾了过去 20 年的文献,以评估大多数引用的 SNP 在不同大陆的结石形成中的作用,为临床医生收集有关遗传学在结石形成中的作用的相关数据。

与肾结石病相关的文献中研究最多的基因是维生素 D 受体基因 (VDR)。V DR基因在钙代谢中起重要作用,位于人类染色体 12q13-12q14 。VDR基因有四种主要的遗传变异,包括GD2228570(FokI)、GD731236(TaqI)、GD7975232(ApaI)和GD1544410(BsmI)。从 1998 年到 2021 年,有 72 篇文章调查了不同 SNP 在VDR中的作用基因被纳入荟萃分析。森林图中每个 SNP 的 OR 总体估计值。VDR的 OR 汇总估计值约为 1.20(95%CI:1.06-1.36),显示两个研究组(肾结石患者和健康对照组)之间存在显着差异。

在病例组和对照组之间存在显着差异的研究中,Nishijima 等人评估了 TaqI 和 ApaI 在肾结石发病机制中的作用。他们得出的结论是,TaqI Tt 和 tt 基因型的发生率在肾结石患者中显着更高,结石形成的风险增加了 5.2 倍。然而,ApaI 在健康和肾结石患者之间没有显着差异。奥兹卡亚等人发现 ApaI AA 基因型在肾结石患者中显着升高(OR:2.27,CI = 1.21-3.42)。在 Redina 等人的两项不同研究中。和 Relan 等人,与肾结石相关的唯一基因型是 GD1544410 (BsmI),OR 分别为 2.03 和 1.81。此外,Relan 等人得出结论,GD 2228570 (FokI) 与肾结石有关 (OR:3.06; CI = 1.7–5.53)。在 Bid 等人的一项研究中,GD 2228570 (FokI) 与肾结石病相关(OR:3.11;CI = 1.88–5.17)。米塔尔等人还发现 GD 2228570 (FokI) 与尿石症的关系 (OR:3.41; CI = 1.98–5.87) 。在 Wang 等人的一项研究中,GD731236 (TaqI) 是VDR基因的一个显着多态性,OR 为 11.5 (CI = 6.41–20.6)。

在图 3,图 4,该基因的亚组分析显示在亚洲患者中存在显着相关性,总体 OR 为 1.24(95%;CI:1.08-1.42)。然而,欧洲和北美研究亚组的估计 OR 不显着(OR = 0.99;95% CI:0.75–1.32,OR = 1.56;95% CI:0.48–5.10)。在 SNP 亚组中,GD2228570 的 OR 总体估计值显示出显着的关系(OR = 1.28;95% CI:1.01-1.62)。在 Imani 等人的一项研究中,他们调查了VDR的作用系统评价中关于肾结石风险增加的基因多态性。他们的结果并未证实 FokI、TaqI、BsmI 和 ApaI 与肾结石的关联。然而,ApaI 和 TaqI SNP 与东亚和高加索人群的尿石症有关。尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队的结果显示在整体汇总荟萃分析中存在显着关联(OR:1.20;95% CI:1.06-1.36)。在亚组分析中,GD2228570 (FokI) 显示出与尿石症显着相关 (OR = 1.28;95% CI:1.01–1.62)。

CASR基因变异是探索的以下基因。CASR是属于G蛋白的二聚体膜蛋白。它主要存在于甲状旁腺和亨利小管的粗升支中,并保持钙稳态。Corbetta 等人的一项研究。评估了 94 名原发性甲状旁腺功能亢进患者的CASR基因变异。他们得出结论,R990G 多态性与甲状旁腺功能亢进参数有关。这种变异 R990G (GD1042636) 与复发性尿石症相关 (OR:3.76; CI = 1.39–10.22)。在 Vezzoli 等人的一项类似研究中,对 124 名无尿石病史的高尿钙患者,他们发现与健康的正常尿钙患者相比,R990G 多态性与高尿钙状态有关(OR:5.2;CI = 1.71-15.79)。

沙赫萨利姆等人与 107 名健康对照组相比,评估了 99名复发性尿路结石患者的CASR多态性。他们发现 990G (GD1042636) 和 986S (GD1801725) 与复发性钙尿石症相关(OR 分别为 7.24 和 2.62)。在 Vezzoli 等人的两项不同研究中,GD1501899 (OR:2.07; CI = 1.37–3.13)、GD6776158 (OR:3.17, CI: 2.14–4.7) 和 GD1042636 (OR:1.88; CI:1.17–3.04)与结石形成有关。Guha 等人的一项研究。揭示CASR基因的GD1042636(OR:2.46;CI:1.64-3.69)和GD1801725(OR:3.09;CI:1.97-4.85)与尿石症有显着相关性。)。在 Ding 等人的一项研究中,GD1042636(OR:1.52;CI:1.09-2.12)被认为是结石形成的危险因素。李等人证实了CASR GD7652589 多态性在中国人群结石病发展中的作用。

在尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队的荟萃分析中,对CASR基因 OR 的总体估计显示与结石形成显着相关(OR = 1.24;95% CI:1.01-1.52)。在按大洲进行的亚组分析中,OR 仅在欧洲和北美患者中具有统计学意义(OR = 1.56;95% CI:1.10-2.22,OR = 1.31;95% CI:1.02-1.67)。关于 SNP 亚组,GD1801725 和 GD1501899 是尿石症的危险因素,OR 值分别为 1.44 (95% CI: 1.06–1.97) 1.65 (95% CI: 1.08–2.51)。

第三个评估基因是 Klotho 基因。该基因是一种具有葡萄糖醛酸酶活性的 1 型跨膜蛋白,在肾钙和磷酸盐稳态中具有拟议的作用。在五项研究中,评估了十个 Klotho 基因变异(;)。Telci 等人评估了 Klotho 基因中的三个 SNP,发现 GD3752472 对尿石症的保护作用。在 Xu 等人的一项研究中,他们评估了 Klotho 基因多态性与肾结石之间的关系。他们得出结论,Klotho基因的GD3752472多态性对结石形成具有保护作用(OR:0.66;CI = 0.44-0.99)。古雷尔等人研究了Klotho基因多态性,发现GD1207568变异对结石形成具有保护作用(OR:0.41;CI:023-0.73)。

尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队的分析表明,Klotho 对感兴趣的结果具有保护作用(OR = OR = 0.75;95% CI:0.57-0.99)。所有关于这个基因的研究都是在亚洲国家进行的,所以尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队没有按大陆进行亚组分析。根据图 9,仅在 GD3752472 中观察到显着的保护优势比(OR = 0.58;95% CI:0.39-0.86)。

以下被评估的基因是骨桥蛋白。骨桥蛋白是一种多功能糖基化磷蛋白。许多人类和动物研究已经提出这种基因多态性是肾结石形成的一个因素。山手等人研究了骨桥蛋白在遗传性肾结石病例中的作用。他们发现在肾结石病例中显着检测到 GD1126616 (OR:13.86; 95% CI: 2.87–67.04) 。高等人评估了骨桥蛋白多态性对 76 例尿石症患者的作用。他们发现肾结石患者与健康患者相比,GD1126616 变异存在显着差异(OR:12.48;95% CI:1.5-103.54)。Gogebakan 等人对肾结石患者的骨桥蛋白多态性进行了另一项研究。他们的结果揭示了 GD1126616 多态性在肾结石发展中的作用(OR:2.01;95%;CI = 1.08-2.72)。

在 Tekin 等人的一项研究中,他们评估了 65 名患有肾结石的儿科患者的OPN基因多态性。GD1126616 在肾结石病例中显着发现 (OR:2.66; 95% CI = 1.24–5.73)。Safarinejad 等人评估了 342 名草酸钙结石患者的骨桥蛋白基因中的 S​​NP。他们的结果显示,GD28357094 TT 基因型(OR:2.52;95% CI = 1.74–3.79;p = 0.021)、GD2728127 GG 基因型(OR:2.64;95% CI1.42–4.81;p = 0.002)和 GD2853744 GG 基因型(OR 1.68;95% CI:1.22–3.87;p = 0.003)与肾结石密切相关。然而,GD9138 AA 基因型对结石形成具有保护作用(OR 0.62,95% CI 0.47–0.81;p = 0.004)。图格库等人评估了 127 例尿石症患者的OPN基因多态性,发现 GD1126616 多态性在病例组和对照组之间存在显着差异(OR:2.94;95%CI = 1.63-5.32)。阿马尔等人在 OPN 基因中发现了三个与结石形成相关的 SNP。GD2853744:G > T、GD11730582:T > C 和 GD11439060:delG > G 与结石形成显着相关(OR = 3.14;p = 0.006,OR = 1.78;p = 0.006 和 OR = 1.60;p = 0.012,分别)。

在肖等人的一项研究中,他们评估了OPN多态性在肾结石形成中的作用。在他们的研究中,对 230 名肾结石患者的三个 SNP,包括 GD28357094、GD11439060 和 GD11730582 进行了基因分型。与对照组相比,唯一与肾结石相关的 SNP 是 GD11439060(OR:1.55;95% 置信区间 (CI) = 1.08-2.22)。

尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队与骨桥蛋白的 OR 相关的结果显示在图 10,图 11. 该基因总体上也显示出显着效果(OR = 1.38;95% CI:1.09-1.74)。GD1126616 (OR = 2.66; 95%CI:1.24–5.68)、GD2728127 (OR = 1.96; 95%CI:1.44–2.68) 和 GD9138 (OR = 2.32; 95%CI:1.80–2.98) 与风险相关肾结石。该基因的其他 SNP 亚组中估计的 OR 没有统计学意义。

评估的最后一个基因是尿激酶尿激酶是一种在肾脏中产生的多功能蛋白质。所提出的肾结石抑制机制影响草酸钙结晶。在 Tsai 等人的一项研究中,他们调查了尿激酶基因多态性在 153 名复发性钙结石患者中的作用。他们的研究结果表明,尿激酶基因 3'-UTR C/T 多态性是结石形成的危险因素(OR:3.088;95% CI = 1.06-8.99,p < 0.05)。在 Mittal 等人的一项类似研究中,他们没有发现尿激酶基因 3'-UTR C/T (GD4065) 多态性与结石形成风险之间的关系(OR:1.78;95% 置信区间 = 0.92-3.44)。Ozturk 等人评估了 3'-UTR C/T 多态性在尿石症中的作用。他们没有发现这种多态性与钙结石形成之间存在任何关系(OR:1.12;CI = 044–2.89)。然而,这种多态性在儿童和复发性尿路结石病例中更为常见。评估了 3'-UTR C > T (GD4065) 多态性在韩国人群肾钙结石中的作用。关于这种多态性,患者和对照组之间没有显着差异(OR:1.23;CI = 085-1.79)。在 Hagikure 等人的一项研究中,他们评估了 P141L (GD2227564) 和 3'-UTR C > T (GD4065) 在日本人群中 232 名钙结石患者中的作用。他们的结果显示这两种多态性与尿石症风险之间没有明确的关系(OR:1.00;CI = 072-1.38,OR:093;CI = 0.6-1.43)。贾瓦德等人评估了 3'-UTR C > T (GD4065) 多态性在伊拉克人群肾钙结石中的作用。这种多态性与结石形成风险之间存在显着关系(OR:3.84;CI = 2.24-6.58)。

图 12,13描述尿激酶基因多态性的荟萃分析。总体优势比在统计学上不显着(OR = 1.52;95%CI:1.02–2.28)。在 GD4065 的 SNP 亚组中也发现了显着的关联(OR = 1.79;95% CI:1.04-3.11),但其他 SNP 亚组中的值无统计学意义(GD2227564,OR = 1;95% CI:0.72-1.38 ) 和 (GD2074725,OR = 1.12;95%CI:0.44–2.89)。

尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队研究的总体发表偏倚(图 14,图 15,图 16) 是可以接受的。尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队研究的显着结构之一是尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队分别评估了高加索种族在结石形成中的作用。这种分类的主要原因是许多研究表明高加索种族显着影响多态性。研究中包含的三个高加索民族国家是:意大利、土耳其和加拿大。一些研究提到,高加索亚群与尿石症风险增加有关,并且该亚群在世界范围内分布。

维佐利等人发现CASR基因多态性(GD1042636)与该种族的肾结石风险相关(OR:5.20;CI = 1.71-15.79)。汉密尔顿等人的一项研究。发现高加索人群中CASR基因多态性(GD1801725)与肾结石(OR:1.64;CI = 1.09-2.46)之间存在显着关系。Gögebakan 等人发现骨桥蛋白基因多态性 (GD1126616) 与高加索人群中的肾结石之间存在关联 (OR:2.01, CI = 1.08–3.72)。

尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队的研究有一些限制。首先,一些研究是在亚洲进行的,但尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队没有任何关于患者种族的数据。多种族可能被认为是一个混杂因素。第二个是将搜索限制为仅英语文章。第三,大多数关于骨桥蛋白、Klotho尿激酶基因多态性的研究都是在亚洲进行的,因此尿结石及肾结石的基因检测预测有效性研究团队建议在其他大陆,包括欧洲和北美,对这些基因进行更多的研究。

 

Genetic Polymorphisms and Kidney Stones Around the Globe: A Systematic Review and Meta-Analysis.

Mohammadi A, Shabestari AN, Baghdadabad LZ, Khatami F, Reis LO, Pishkuhi MA, Kazem Aghamir SM.Front Genet. 2022 Jun 30;13:913908. doi: 10.3389/fgene.2022.913908. eCollection 2022.PMID: 35846117 

 

(责任编辑:佳学基因)
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