【佳学基因检测】荧光原位杂交(FISH)在实体瘤诊断和个体化治疗中的应用

 

荧光原位杂交基因检测导读：

荧光原位杂交(FISH)是一种重要的分子病理学检测技术,通过使用荧光标记的DNA探针与组织或细胞中的特定基因或染色体区域杂交,可以检测基因的数目、结构和位置等异常情况。

在实体瘤诊断方面,FISH技术主要用于:

鉴别肿瘤的类型和亚型,如通过检测特定的基因重排(如EWSR1-FLI1在Ewing肉瘤中)进行分型。

评估预后相关的分子标志物,如HER2基因扩增在乳腺癌中与较差预后相关。

检测肿瘤特征性的染色体异常,如慢性骨髓性白血病的费城染色体。

在个体化治疗方面,FISH检测结果可以指导靶向药物的选择:

检测驱动基因的扩增或者过度表达,如EGFR、HER2等,可用于选择相应的小分子靶向药物或单克隆抗体。

检测基因重排,如ALK、ROS1等,可用于选择相应的酪氨酸激酶抑制剂。

检测抗肿瘤药物靶点的状态,如TOPO2A基因扩增可用于预测对蒽环类药物的反应。

综上所述,FISH技术为实体瘤的分子分型诊断和靶向治疗药物的精准使用提供了重要的分子依据,是现代精准肿瘤学不可或缺的分子病理检测手段。

荧光原位杂交（FISH）是基因异常常规诊断中的标准技术

荧光原位杂交（FISH）是基因异常常规诊断中的标准技术。由于FISH操作简单，佳学基因肿瘤基因检测可以识别肿瘤特异性异常。其应用仅限于设计的探针类型。基因重排，例如ALK、ROS1反映多个易位伙伴，关键区域的缺失，例如1p和19q，基因融合，例如COL1A1-PDGFB，基因组失衡，例如6p、6q、11q和扩增，例如HER2，是个性化肿瘤学的目标。遗传标记的确认通常是开始特定、靶向治疗的直接指标。在其他情况下，检测到的异常有助于病理学家更好地区分软组织肉瘤，或作出最终诊断。佳学基因的主要目标是表明，将FISH应用于福尔马林固定石蜡包埋组织样本（FFPE）可以评估来自原发性肿瘤或转移瘤的细胞群中的基因组状态。尽管有许多更先进的技术可供使用，例如实时PCR或新一代测序，但FISH仍然是许多遗传实验室中常用的方法。

荧光原位杂交(FISH)在实体瘤诊断和个体化治疗中的应用关键词

ALK；COL1A1-PDGFB；FISH；HER2；ROS1；个性化医学；个性化肿瘤学；t（X，18）；靶向治疗。

佳学基因是如何理解荧光原位杂交技术的？

原位杂交筛查在个性化医学中起到支持作用。多种已知的异常现象，包括由易位、插入或倒位导致的重排、缺失（删除）和增益（例如扩增），主要可以通过荧光原位杂交（FISH）来评估。在某些情况下，色原原位杂交（CISH）也被引入到分子病理学和分子肿瘤学领域。两种原位杂交方法都基于相同的原理，即与感兴趣的区域进行退火、检测、评估和空间定位。这两种方法的主要区别在于基因组区域的标记方法，可以使用生物素或地高辛（CISH），或者使用荧光标记（FISH），然后使用适当的检测系统。对于用生物素标记的探针，使用与辣根过氧化物酶（HRP-链霉亲和素）结合的链霉亲和素进行检测。对于带有地高辛的探针，使用抗地高辛荧光素一抗，随后使用与荧光素结合的HRP二抗，并在明场显微镜下计数信号。FISH检测是直接进行的，需要荧光显微镜。遗传标记的检测通常在患者决策中起到关键作用，从患者风险分层到实施适当的治疗。这两种原位技术都用于该领域。例如，与FISH相比，CISH在检测HER-2/neu基因扩增方面的灵敏度为97.5%，特异性为94%。在一组4460例乳腺癌患者的FISH和CISH结果的一致性率为96%，表明CISH是一种与FISH相当的技术。大多数资料都认为，在基因扩增检测中，FISH和CISH的表现几乎相同。然而，由于17号染色体的多体性，CISH对于低水平扩增的灵敏度可能较低。对于使用FISH和CISH检测的ALK（ALK受体酪氨酸激酶）重排，也有类似的观察结果。在对449个样本的测试中，这两种方法分别显示出19个和18个ALK阳性样本。CISH的灵敏度为94.4%，特异性为100%。虽然每种诊断工具，不仅基于杂交，还基于蛋白质表达，如免疫组织化学（IHC），都有其优点和缺点，但FISH技术目前被认为是参考方法。

原位检测的另一替代方法是使用mRNA作为生物标志物。该技术使用与测试的mRNA分子互补的单链DNA探针。标准程序包括消化、杂交、使用抗地高辛抗体和标记有HRP的二抗进行检测，以及使用显色剂（例如DAB，即3,3'-二氨基联苯胺）和明场显微镜对结果进行可视化。与上述ISH技术相比，mRNAISH更快、更便宜、制备更容易且毒性更低。可以使用即用型试剂盒对福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本中的乳腺癌HER2基因表达进行评估。与其他基于mRNA评估的技术一样，其主要限制是核糖核酸的稳定性较差。

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