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【佳学基因检测】RNAseq测序科研服务基因检测中的质量控制和序列拼接

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佳学基因检测】RNAseq测序科研服务基因检测中的质量控制和序列拼接


基因解码中的RNAseq为佳学基因提供解析新的变异体、新的序列突变的强大能力,这是为什么采用基因解码方法进行基因检测和致病基因鉴定要优于数据库比对的根本原因。佳学基因提供的基因解码分析手段是将研究级别的严谨应用于临床病例的分析中,从而为医生将单个病例转化为发表级数据。其中,由佳学基因开发的单轨分析管道使用标准工具分析RNA-seq数据和编制QCr质量控制标准。这包括:(a)使用STAR方法以特殊方式使RNA seq序列与参照基因组进行比对。(b)采用比肩seqtk的方法分析碱基信号质量并用来分析碱基的组成。(c)以优于Megadepth的方法来揭示样品中的片段长度、在全部染色体的覆盖率及覆盖分布,(d)通过featureCounts进行基因表达水平的粗略QC分析。请致电4001601189,以了解关于科研服务中RNA测序中如何获得表达谱及剪接方式分析。




 

(责任编辑:佳学基因)
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